Show HN: 850万件の研究論文をインタラクティブなアトラスにマッピングしました

論文を読むとき、データセット、コード、動画、ピアレビューなどを見つけるために複数のタブを切り替える必要があります。このプロジェクトでそれを修正しようとしました。 最初はarXivの論文だけのプロジェクトでしたが、Twitterでの初期の成功（1.9kビューを獲得しました。これは私が投稿した中で最も多いビューです）の後、PubMed Central、bioRxiv、medRxiv、eLifeから公開されている他の論文も追加しました。これらの論文は、遺伝子、タンパク質、疾患、薬剤、臨床試験、3Dタンパク質構造、コード、引用された論文、類似論文とリンクされています。 このプロジェクトには現在4つの部分があります。 まず、マップです。私は約850万件の論文（SPECTER2を使用）を埋め込み、UMAPを2D表現のために実行し、それらを散布図としてレンダリングしました。ドットをクリックすると、LLMによるTLDR、主要な発見、ピアレビュー、リンクされたエンティティなど、論文に関する簡単な情報を表示できます。クラスターにもラベルが付いていますが、ズームインする必要があるかもしれません。 次に、各論文の詳細なページを作成しました。論文の全文、画像、動画、ピアレビュー（OpenReviewから）、GitHubリンク、Hugging Faceのデータセット/モデルリンク、臨床試験、遺伝子、疾患、3Dタンパク質構造、引用された論文、類似論文を提供します。LLM用に、全文と画像URL全体を含むページ全体をマークダウンとしてコピーすることもできます。 第三に、拡張機能をリリースしました。これにより、arXiv、PMC、bioRxiv、Google Scholar、またはmedRxivに表示される「Tomesphereで開く」をクリックするだけで、サイドバーですべての情報にアクセスできます。拡張機能には可能な限り多くの情報を提供するようにしましたが、すべての画像や3Dタンパク質構造を表示するなど、一部の機能では拡張機能に提供されているリンクを使用して論文ページに移動する必要があるかもしれません。 第四に、このすべてのデータはMCPを介してLLMで利用できます。MCPには50クエリの無料制限があります（サインアップすると10倍になります）。 注意: このプロジェクトはまだベータ版なので、論文に一部情報が一致しない場合があります。データ品質を向上させるために、まもなくフィードバックフォームを展開します。お読みいただき、誠にありがとうございます。